Yayasan Perguruan Tinggi Gereja Protestan Maluku (YAPERTI GPM) dibentuk pada tanggal 17 Juni 1985 dan menyelenggarakan misi Gereja Protestan Maluku di bidang pendidikan tinggi dan melaksanakan perannya sebagai Badan Penyelenggara Perguruan Tinggi Swasta Universitas Kristen Indonesia Maluku (UKIM) sebagaimana ketentuan perundang-undangan.